Microscopie et Microfluidique (contenu)

Microscopie et Microfluidique (contenu)

Mis à jour le

Le CMAbio3 conseille, accompagne et forme ses utilisateurs à l’utilisation de différents types de microscopes photoniques et électroniques, d’équipements de préparation d’échantillons et de microfluidique.

Spécialisée dans la préparation des échantillons pour la microscopie électronique en biologie, la plateforme dispose aussi de quelques équipements pour préparer les échantillons pour la microscopie optique.

Les service dispose d’une chaîne de fabrication de puces microfluidique par photolithographie et d’une fraiseuse 5 axes pour fabriquer des systèmes de cultures plus grand. Un système de gestion microfluidique est aussi disponible.

Enfin, la plateforme propose un service de traitement et d’analyse des images d’échantillons biologiques obtenues à partir de nos systèmes ou d’autres capteurs. Ils sont réalisés à l’aide de logiciels libres et des applications plus spécifiques peuvent être développées en interne. Le personnel du CMAbio3 effectue des prestations, du conseil, forme les étudiants, techniciens, chercheurs de l’Université ou les utilisateurs externes à l’établissement, à toutes les techniques de préparation, d’observation des échantillons et de traitement/analyse des images.

Les activités sont organisées sur trois plateaux techniques :

CMAbio

Le plateau de microscopie (CMAbio) est équipé pour l’observation d’échantillons aux différentes échelles tissulaires, cellulaires et ultrastructurales par microscopie photonique et électronique. Ce plateau technique peut prendre en charge toutes les étapes du traitement d’échantillons biologiques et leur observation en microscopie électronique à transmission (MET). L’ingénieur a aussi un accès aux  MEB, MEB-EDS, LVMEB du CRISMAT (ENSICAEN). Le service dispose d’un vibratome, d’une cytocentrifugeuse d’un appareil à point critique, d’un ultramicrotome, d’un cryoultramicrotome, d’un système de cryobusbtitution et d’un système de cryotransfert pour MEB. Nous disposons aussi d’équipements pour des diverses modalités d’observation en macroscopie, microscopie lumière blanche/fluoresence et microscopie confocale à balayage laser. Le personnel affecté au plateau accompagne les chercheurs dans leurs travaux en leur transmettant leur savoir-faire et accueille des étudiants au cours de formations courtes pour leur faire découvrir ces technologies.

Contacts : Nicolas ELIE (photonique)  et Didier GOUX (électronique)

MicroFluDesign

Le plateau MicroFluDesign qui est un plateau dédié à la conception et la production de puces/systèmes microfluidiques dédiés à la biologie. Les équipements permettent le développement de compétences synergiques et originales en microfluidique, microscopie et analyses de micro-environnements. Ces approches pourront être couplées à la microscopie et l’analyse chimique et moléculaire de micro-environnements complexes pour la caractérisation du vivant et de la biodiversité. Des approches continue (micro canaux) ou discrète (de gouttes dite microfluidique digitale) peuvent permettre d’effectuer des opérations variées en parallèle sur un grand nombre d’échantillons basées notamment sur du tri cellulaire (à des fins de diagnostic ou biotechnologique). Ces dispositifs d’analyse microfluidique sont fabriqués le plus souvent avec les outils de la microélectronique, et peuvent par exemple être des « organes sur puces » ou des « plantes sur puces ». L’ensemble du personnel du service va acquérir ces techniques pour les mettre au service de la communauté. Venez avec vos questions et vos échantillons.

Contacts :  Didier GOUX, Nicolas ELIE

  • Microscopes optiques de lumière blanche et de fluorescence
  • Microscope confocal (6 ray LASERS)
  • Microscope électronique à transmission, accès au MET EDS et ARM du CRISMAT
  • Accès à des Microscopes électroniques à balayages-EDS et système de cryotransfert
  • Macroscope motorisé
  • Système de microscopie corrélative optique/MEB
  • Vibratome
  • Cytocentrifugeuse
  • Système de cryosubstitution
  • Appareil à contournement du point critique
  • Ultramicrotome
  • Cryo-ultramicrotome
  • Système de glow discharge
  • Système de microinjection
  • Chaîne de fabrication de puces PDMS (Dilase 125)
  • Système de gestion microfluidique
  • Fraiseuse 5 axes

ZEN, ZEN Connect, Olympus CellSens, Digital Micrograph, Qupath, ImageJ, FIJI, Ilastik, OMERO