La plateforme PROTEOGEN propose différents services d’analyses en spectrométrie de masse pour réaliser :

• Des identifications de modifications post-traductionnelles (méthylation, phosphorylation, …),
• Des caractérisation de protéomes et peptidomes complexes (interactomes, ….),
• Des approches de protéomique et peptidomique quantitative comparative afin de comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents à des observations physiopathologiques.

Les analyses sont réalisées en 4 dimensions, en DIA ou DDA sur un système nanoLC-TIMS TOF Pro (Bruker) Les analyses bioinformatiques résultantes (identification, normalisation, statistiques, enrichissement en GO terms, mapping des pathway, …) sont également réalisées via différents logiciels et services web dédiés.