Équipements

Les équipements du CBM lui permettent de remplir les différentes missions d’une collection de ressources biologiques :

  1. Conservation : Equipements de cryopréservation et lyophilisation de souches microbiennes : congélateurs (4), centrifugeuse, lyophilisateur
  2. Inventaire de biodiversité : MALDI-Biotyper, Bionumerics, Compteur de colonie, Precellys
  3. Caractérisation technologique : Systèmes de cultures microbiennes (3), Lecteur de plaques TECAN-SPARK, i-Cinac, GC-MS
  4. Cellule de production de ferments : Incubateurs, Centrifugeuse, Bioréacteur 5L

Le plateau CBM-UCMA compte 20 équipements dont la moitié sont des équipements technologiques originaux lui permettant d’assurer ses 4 missions essentielles de conservation, inventaire de biodiversité, caractérisation technologique et production de ferments.

Préparation d’échantillons

Microscopie

Microfluidique

Analyse de la composition élémentaire

  • Spectromètre à torche plasma à couplage inductif haute résolution (HR ICP-MS) Element 2 (Thermo Fisher),
  • Spectromètre de fluorescence des rayons X (XRF) XEPOS (AMETEK) permettant des mesures sous hélium.

Analyse des isotopes stables N, C, S, O, H/D

  • Spectromètre de masse Isoprime (GV Instrument,Elementar), couplé à un analyseur élémentaire Euro EA (Eurovector), un passeur gaz-liquide 222 XL (Gilson) et une chromatographie en phase gazeuse GC-C 6890N GC System (Agilent Technologies).
  • Spectromètre de masse Delta V advantage (Thermofisher), couplé à un analyseur élémentaire EA Isolink CNSOH (Thermofisher), un passeur gaz-liquide Gas Bench II (Thermofisher), un préconcentrateur de gaz traces Precon (Thermofisher) et un analyseur de TOC EA Isolink CN (Thermofisher).

Analyse des isotopes stables N, C, S, O, H/D

  • Spectromètre de masse Isoprime (GV Instrument,Elementar), couplé à un analyseur élémentaire Euro EA (Eurovector), un passeur gaz-liquide 222 XL (Gilson) et une chromatographie en phase gazeuse GC-C 6890N GC System (Agilent Technologies).
  • Spectromètre de masse Delta V advantage (Thermofisher), couplé à un analyseur élémentaire EA Isolink CNSOH (Thermofisher), un passeur gaz-liquide Gas Bench II (Thermofisher), un préconcentrateur de gaz traces Precon (Thermofisher) et un analyseur de TOC EA Isolink CN (Thermofisher).

Préparation des échantillons

  • Systèmes d’électrophorèse
  • Sorbonnes
  • Centrifugeuses
  • Thermomixers
  • Speed vac

Analyse en Spectrométrie de masse

  • nanoHPLC-TIMS-TOF Pro (Bruker)

Bioinformatique

  • Cytoscape (Cytoscape Consortium)
  • Mascot (Matrix Science)
  • DIA-NN (Institute of Biochemistry Berlin)
  • MaxQuant (Max-Planck Institute of Biochemistry)
  • Perseus (Max-Planck Institute of Biochemistry)
  • Peaks XPro (Bioinformatics Solutions Inc.)
  • Skyline 20.1 (MacCoss Lab Software)
  • Utilisation de scripts R
  • Four à Calcination Carbonite : Four pouvant monter jusqu’à 1100°C.
  • Machine à Cisaillement : détermination de résistance au cisaillement drainé, consolidé d’un matériau de sol en cisaillement direct.
  • Oedomètre : Détermination du tassement d’un échantillon de sol sous un effort donné, et son gonflement au cours du déchargement des efforts soumis auparavant.
  • Analyse des fractions d’un sol de 2µm à 2mm
  • Loupe binoculaire pour palynologie
  • Tamiseuse Retsch AS200 : Tamisage automatique allant de 100µm à 2mm.
  • Granulométrie : Granulomètre Mastersizer 2000