Les équipements du CBM lui permettent de remplir les différentes missions d’une collection de ressources biologiques :
- Conservation : Equipements de cryopréservation et lyophilisation de souches microbiennes : congélateurs (4), centrifugeuse, lyophilisateur
- Inventaire de biodiversité : MALDI-Biotyper, Bionumerics, Compteur de colonie, Precellys
- Caractérisation technologique : Systèmes de cultures microbiennes (3), Lecteur de plaques TECAN-SPARK, i-Cinac, GC-MS
- Cellule de production de ferments : Incubateurs, Centrifugeuse, Bioréacteur 5L
Le plateau CBM-UCMA compte 20 équipements dont la moitié sont des équipements technologiques originaux lui permettant d’assurer ses 4 missions essentielles de conservation, inventaire de biodiversité, caractérisation technologique et production de ferments.
Préparation d’échantillons
Appareil à contournement du point critique CPD030 LEICA Appareil de glow discharge ELMO CORDOUAN Cryo-ultramicrotome, RMC Powertome coupe ultra-fine d’échantillon congelé Ultramicrotome, coupe Semi-fines et Ultra-Fines Leica Ultracut R Système de cryosubstitution 7500 RMC Cytosmin 4 Thermo Vibratome
Microscopie
Microscope inversé axio observer zeiss Microscope électronique à balayage LV EDS JEOL 7200 du CRISMAT Microscope confocal FV1000 olympus Microscope olympus BX53 Macroscope Axio zoom Zeiss Macroscope Axio zoom Zeiss Microscope electronique à transmission 10 11JEOl Miccroscope électronique à balayage EDS ZEISS-SUPRA55-1du CRISMAT avec cryotransfert Quorurm
Microfluidique
Puces en PMMA (plexiglass) ou en PDMS (silicone) avec lamelle de microscopie Puces en PMMA (plexiglass) ou en PDMS (silicone) avec lamelle de microscopie Puces en PMMA (plexiglass) ou en PDMS (silicone) avec lamelle de microscopie puce thermostatée au microscope puce au microscope puce thermostatée au microscope puce thermostatée au microscope Polymérisation par écriture laser Polymérisation par écriture laser Microfraisage de puce sur PMMA Microfraisage de puce sur PMMA Microfraisage de puce sur PMMA Microfraisage de puce sur PMMA Microfraisage de puce sur PMMA Macroscope Imprimante 3D Système de gestion des flux Fluigent Spin coater pour le dépôt homogène de résine de quelques dizaine, centaine de nm d'épaisseur Système de nettoyage au plasma fraiseuse 5 axes Pocket NC Systéme d'eccriture laser Dilsae 125 KLOE
Analyse de la composition élémentaire
- Spectromètre à torche plasma à couplage inductif haute résolution (HR ICP-MS) Element 2 (Thermo Fisher),
- Spectromètre de fluorescence des rayons X (XRF) XEPOS (AMETEK) permettant des mesures sous hélium.
Analyse des isotopes stables N, C, S, O, H/D
- Spectromètre de masse Isoprime (GV Instrument,Elementar), couplé à un analyseur élémentaire Euro EA (Eurovector), un passeur gaz-liquide 222 XL (Gilson) et une chromatographie en phase gazeuse GC-C 6890N GC System (Agilent Technologies).
- Spectromètre de masse Delta V advantage (Thermofisher), couplé à un analyseur élémentaire EA Isolink CNSOH (Thermofisher), un passeur gaz-liquide Gas Bench II (Thermofisher), un préconcentrateur de gaz traces Precon (Thermofisher) et un analyseur de TOC EA Isolink CN (Thermofisher).
Analyse des isotopes stables N, C, S, O, H/D
- Spectromètre de masse Isoprime (GV Instrument,Elementar), couplé à un analyseur élémentaire Euro EA (Eurovector), un passeur gaz-liquide 222 XL (Gilson) et une chromatographie en phase gazeuse GC-C 6890N GC System (Agilent Technologies).
- Spectromètre de masse Delta V advantage (Thermofisher), couplé à un analyseur élémentaire EA Isolink CNSOH (Thermofisher), un passeur gaz-liquide Gas Bench II (Thermofisher), un préconcentrateur de gaz traces Precon (Thermofisher) et un analyseur de TOC EA Isolink CN (Thermofisher).
Préparation des échantillons
- Systèmes d’électrophorèse
- Sorbonnes
- Centrifugeuses
- Thermomixers
- Speed vac
Analyse en Spectrométrie de masse
- nanoHPLC-TIMS-TOF Pro (Bruker)
Bioinformatique
- Cytoscape (Cytoscape Consortium)
- Mascot (Matrix Science)
- DIA-NN (Institute of Biochemistry Berlin)
- MaxQuant (Max-Planck Institute of Biochemistry)
- Perseus (Max-Planck Institute of Biochemistry)
- Peaks XPro (Bioinformatics Solutions Inc.)
- Skyline 20.1 (MacCoss Lab Software)
- Utilisation de scripts R
- Four à Calcination Carbonite : Four pouvant monter jusqu’à 1100°C.
- Machine à Cisaillement : détermination de résistance au cisaillement drainé, consolidé d’un matériau de sol en cisaillement direct.
- Oedomètre : Détermination du tassement d’un échantillon de sol sous un effort donné, et son gonflement au cours du déchargement des efforts soumis auparavant.
- Analyse des fractions d’un sol de 2µm à 2mm
- Loupe binoculaire pour palynologie
- Tamiseuse Retsch AS200 : Tamisage automatique allant de 100µm à 2mm.
- Granulométrie : Granulomètre Mastersizer 2000