Les équipements du CBM lui permettent de remplir les différentes missions d’une collection de ressources biologiques :
- Conservation : Equipements de cryopréservation et lyophilisation de souches microbiennes : congélateurs (4), centrifugeuse, lyophilisateur
- Inventaire de biodiversité : MALDI-Biotyper, Bionumerics, Compteur de colonie, Precellys
- Caractérisation technologique : Systèmes de cultures microbiennes (3), Lecteur de plaques TECAN-SPARK, i-Cinac, GC-MS
- Cellule de production de ferments : Incubateurs, Centrifugeuse, Bioréacteur 5L
Le plateau CBM-UCMA compte 20 équipements dont la moitié sont des équipements technologiques originaux lui permettant d’assurer ses 4 missions essentielles de conservation, inventaire de biodiversité, caractérisation technologique et production de ferments.
Préparation d’échantillons
Microscopie
Microfluidique
Analyse de la composition élémentaire
- Spectromètre à torche plasma à couplage inductif haute résolution (HR ICP-MS) Element 2 (Thermo Fisher),
- Spectromètre de fluorescence des rayons X (XRF) XEPOS (AMETEK) permettant des mesures sous hélium.
Analyse des isotopes stables N, C, S, O, H/D
- Spectromètre de masse Isoprime (GV Instrument,Elementar), couplé à un analyseur élémentaire Euro EA (Eurovector), un passeur gaz-liquide 222 XL (Gilson) et une chromatographie en phase gazeuse GC-C 6890N GC System (Agilent Technologies).
- Spectromètre de masse Delta V advantage (Thermofisher), couplé à un analyseur élémentaire EA Isolink CNSOH (Thermofisher), un passeur gaz-liquide Gas Bench II (Thermofisher), un préconcentrateur de gaz traces Precon (Thermofisher) et un analyseur de TOC EA Isolink CN (Thermofisher).
Analyse des isotopes stables N, C, S, O, H/D
- Spectromètre de masse Isoprime (GV Instrument,Elementar), couplé à un analyseur élémentaire Euro EA (Eurovector), un passeur gaz-liquide 222 XL (Gilson) et une chromatographie en phase gazeuse GC-C 6890N GC System (Agilent Technologies).
- Spectromètre de masse Delta V advantage (Thermofisher), couplé à un analyseur élémentaire EA Isolink CNSOH (Thermofisher), un passeur gaz-liquide Gas Bench II (Thermofisher), un préconcentrateur de gaz traces Precon (Thermofisher) et un analyseur de TOC EA Isolink CN (Thermofisher).
Préparation des échantillons
- Systèmes d’électrophorèse
- Sorbonnes
- Centrifugeuses
- Thermomixers
- Speed vac
Analyse en Spectrométrie de masse
- nanoHPLC-TIMS-TOF Pro (Bruker)
Bioinformatique
- Cytoscape (Cytoscape Consortium)
- Mascot (Matrix Science)
- DIA-NN (Institute of Biochemistry Berlin)
- MaxQuant (Max-Planck Institute of Biochemistry)
- Perseus (Max-Planck Institute of Biochemistry)
- Peaks XPro (Bioinformatics Solutions Inc.)
- Skyline 20.1 (MacCoss Lab Software)
- Utilisation de scripts R
- Four à Calcination Carbonite : Four pouvant monter jusqu’à 1100°C.
- Machine à Cisaillement : détermination de résistance au cisaillement drainé, consolidé d’un matériau de sol en cisaillement direct.
- Oedomètre : Détermination du tassement d’un échantillon de sol sous un effort donné, et son gonflement au cours du déchargement des efforts soumis auparavant.
- Analyse des fractions d’un sol de 2µm à 2mm
- Loupe binoculaire pour palynologie
- Tamiseuse Retsch AS200 : Tamisage automatique allant de 100µm à 2mm.
- Granulométrie : Granulomètre Mastersizer 2000